Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prkd1Q62101 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Prkd1Q62101 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Prkd1Q62101 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Prkd1Q62101 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd1Q62101 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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