Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cd53Q61451 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cd53Q61451 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cd53Q61451 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cd53Q61451 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cd53Q61451 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cd53Q61451 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cd53Q61451 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cd53Q61451 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cd53Q61451 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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