Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms