Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms