Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms