Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irgm1Q60766 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irgm1Q60766 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irgm1Q60766 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irgm1Q60766 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Irgm1Q60766 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irgm1Q60766 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Irgm1Q60766 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Irgm1Q60766 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irgm1Q60766 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irgm1Q60766 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irgm1Q60766 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irgm1Q60766 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Irgm1Q60766 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Irgm1Q60766 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Irgm1Q60766 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Irgm1Q60766 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Irgm1Q60766 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Irgm1Q60766 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Irgm1Q60766 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irgm1Q60766 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms