Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms