Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms