Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms