Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PtprnQ60673 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PtprnQ60673 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PtprnQ60673 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PtprnQ60673 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PtprnQ60673 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PtprnQ60673 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PtprnQ60673 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PtprnQ60673 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PtprnQ60673 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PtprnQ60673 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtprnQ60673 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtprnQ60673 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprnQ60673 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms