Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr1h2Q60644 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms