Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms