Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms