Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam71bQ5STT6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms