Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms