Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sun3Q5SS91 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms