Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS90

Gm11992, Uncharacterized protein C7orf57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11992Q5SS90 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11992Q5SS90 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11992Q5SS90 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11992Q5SS90 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11992Q5SS90 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11992Q5SS90 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11992Q5SS90 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms