Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms