Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV8

Pfpl, Pfpl protein, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfplQ5RKV8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PfplQ5RKV8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PfplQ5RKV8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms