Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms