Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms