Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim58Q5NCC9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms