Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms