Protein–RNA interactions for Protein: Q505F1

Nr2c1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2c1Q505F1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c1Q505F1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms