Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Trp53i11Q4QQM4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trp53i11Q4QQM4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trp53i11Q4QQM4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trp53i11Q4QQM4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trp53i11Q4QQM4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trp53i11Q4QQM4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trp53i11Q4QQM4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trp53i11Q4QQM4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms