Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
H2al1nQ497L1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms