Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms