Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prr7Q3V0I2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms