Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zmat1Q3V0C1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zmat1Q3V0C1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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