Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms