Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms