Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim40Q3UWA4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms