Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn13Q3UW68 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms