Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cnga4Q3UW12 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms