Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV31

Rnf223, RING finger protein 223, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf223Q3UV31 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf223Q3UV31 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf223Q3UV31 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf223Q3UV31 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf223Q3UV31 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf223Q3UV31 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf223Q3UV31 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf223Q3UV31 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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