Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms