Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms