Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UPC7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UPC7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3UPC7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3UPC7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms