Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms