Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BtrcQ3ULA2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms