Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmod2Q3UHZ5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms