Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitpnm3Q3UHE1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitpnm3Q3UHE1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms