Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms