Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rnf180Q3U827 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Rnf180Q3U827 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rnf180Q3U827 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rnf180Q3U827 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rnf180Q3U827 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Rnf180Q3U827 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf180Q3U827 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
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Rnf180Q3U827 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf180Q3U827 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf180Q3U827 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf180Q3U827 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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