Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U6N9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms