Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam117bQ3U3E2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms