Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms