Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf149Q3U2C5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf149Q3U2C5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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