Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms