Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms